Eukaryotische Lysate

Eukaryotische Lysate
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Translationsaktive Lysate stellen die Grundlage für die Synthese von Proteinen in zellfreien Systemen dar. Für die Darstellung von posttranslational modifizierten Proteinen, wie z.B. Glykoproteine und membranständige Proteine, sind endogene Mikrosomen in eukaryotischen Lysaten essentiell, um eine korrekte Translokation in die Mikrosomenmembran zu gewährleisten. Die Arbeitsgruppe Eukaryotische Lysate bietet langjährige Erfahrung in der Kultivierung von eukaryotischen Zelllinien und deren Überführung in translationsaktive Lysate für die Synthese von Proteinen. Einen hohen Stellenwert nimmt die Austestung neuer Zelllinien auf ihre In-vitro-Expressionsfähigkeit ein. Die Entwicklung und stetige Weiteroptimierung von eukaryotischen zellfreien Translationssystemen ist ein wichtiger Forschungsbereich der Arbeitsgruppe. Hierbei ist der Einfluss von Fermentation, Zellaufschluss, aber auch der Transkriptions- und Translationskomponenten auf die Produktivität der Lysate von entscheidendem Interesse.

Validierung der Proteinsynthese

Während einer Evaluierung von Proteinsynthesen in zellfreien Systemen, wird die generelle Expressionsfähigkeit des Templates untersucht. Hierfür kann ein vergleichendes Screening in verschiedenen Systemen (Lysate auf Basis von E. coli Zellen, kultivierten Insekten-, CHO- und humanen Zelllinien sowie Weizenkeimlysate) durchgeführt werden, um das optimale System für die Synthese des Zielproteins zu identifizieren. Als Template können neben Plasmiden auch lineare Konstrukte, wie PCR-Produkte oder auch direkt mRNA verwendet werden. Für die Proteinsynthese stehen unterschiedliche Reaktionsformate zur Verfügung um eine maximale Proteinausbeute zu erzielen. Die Proteinsynthesen sind standardisierbar und können auch unter GLP-Richtlinien durchgeführt werden.

Fermentation von eukaryotischen Zelllinien

Die Basis für die zellfreie Proteinsynthese stellen eukaryotische Zelllysate dar. Um diese in translationsaktiver Form zu erhalten, werden definierte Zelllinien unter geeigneten Bedingungen kultiviert. Durch optimale Wachstumsbedingungen der Zelllinien als Suspensionskultur in chemisch definierten Medien in Fermentern und standardisierten Herstellungsprotokollen, wird eine gleichbleibende Qualität der Lysate für die zellfreie Synthese von Proteinen sichergestellt. Für die Fermentation der Zelllinien können verschiedene Reaktionsführungen (Batch, Repeated Batch oder die kontinuierliche Reaktionsführung (Perfusion)), angepasst an die Zelllinie, durchgeführt werden.

  • Fermentation von eukaryotischen Zelllinien in Suspensionskultur
  • Herstellung von translationsaktiven Lysaten und deren Integrierung in zellfreie Systeme
  • Entwicklung eukaryotischer zellfreier Translationssysteme
  • Test neuer Zelllinien auf ihre In-vitro-Expressionsfähigkeit
  • Validierung von DNA und mRNA-Templaten
  • Integrierung von regulatorischen Sequenzen, Signalpeptiden, IRES-Sites, Aufreinigungs- und Fluoreszenz-Tags über die Generierung von linearen Templaten
  • Zellfreie Synthese von schwer zu exprimierenden Proteinen, wie zytotoxische Proteine und Membranproteine
  • Evaluierung der Proteinsynthese unter Verwendung verschiedener zellfreier Systeme (Lysate aus Insektenzellen, CHO-Zellen, kultivierte humane Zellen; E. coli und Weizenkeimlysate) im Batch und im Dialyse-Modus (CECF)
  • MS-Analysen von Peptiden, Proteinen (Identifizierung, Charakterisierung und Untersuchung von Modifikationen, wie Glykosylierung, Phosporylierung, Palmitylierung), Protein-Protein sowie Protein-Ligand Interaktionen
  • Bestimmung der Syntheseausbeute mittels (14C)-Protein-Labeling und TCA-Präzipitation
  • Charakterisierung der Proteinsynthese durch Gelelektrophorese, Autoradiographie und quantitatives Imaging im Phosphorimager Protein-Analyse mittels Fluoreszenz-Mikroskopie und Western Blotting

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